Régine Vignes-Lebbe


Sorbonne Université ; ISYEB, UMR7205
MNHN Département Histoire de la Terre
Bâtiment de Géologie, CP48
57 rue Buffon, F-75005 Paris (France)
tél : 01.40.79.80.61 (+33 1 40 79 80 61)
adel : regine.vignes_lebbe

Situation actuelle :Professeur Sorbonne Université

Spécialité : Informatique appliquée à la biodiversité (bases de données et bases de connaissances - méthodes de classification, d'identification et d'analyse des descriptions morphologiques)

Responsabilités
Membre réélu en 2016 au conseil d’administration de l’UFR 918 TEB, SU
Membre de la commission des enseignements
Membre nommé dans la commission sectorielle IRD "Sciences des données et des modèles".
Coordination scientifique du GBIF France Voir...
ex-Présidente de la Commission Scientifique de l'UFR 918 Terre, Environnement, Biodiversité, et du Conseil scientifique de l'OSU Ecce Terra(UPMC, jusqu'en 2017)
Responsable du sous-parcours "Informatique pour la Biodiversité" de la formation de master "Systématique, Evolution, Paléobiodiversité" conjointe SU-MNHN (mention BEE).

Enseignement
J'enseigne en L2 et L3 en formation pro (statistiques, informatique-bureautique)
J'enseigne dans le master "Systématique, Evolution, Paléobiodiversité" (Bases de la taxonomie, Discrimination et identification taxonomique, Bases de données et web, Formalisation des connaissances)
J'interviens dans le module de l'école doctorale du MNHN, intitulé "Analyse à trois éléments en systématique et biogéographie", ainsi que dans un module sur les collections.

Publications (quelques publications récentes)

  • Troudet, J., Vignes-Lebbe, R., Grandcolas, P., & Legendre, F. (2018). The increasing disconnection of primary biodiversity data from specimens: How does it happen and how to handle it?. Systematic biology, 67(6), 1110-1119.

  • Jouveau S., Delaunay M., Vignes-Lebbe R. & Nattier R., (2018). A multi-access identification key based on colour patterns in ladybirds (Coleoptera,Coccinellidae). ZooKeys . N° 758, p. 55-73. ISSN: 1313-2989. https://dx.doi.org/10.3897/zookeys

  • Dubuisson J.-Y., Bouquin S. & Vignes-Lebbe R., 2018 — Outil d’identification informatisé : Xper et Orchidées de France métropolitaine. L'Orchidophile. Vol. 219, p. 311-318.

  • Troudet, J., Grandcolas, P., Blin, A., Vignes-Lebbe R.& Legendre F. (2017). Taxonomic bias in biodiversity data and societal preferences. Scientific reports 7 (1), 9132.

  • Joly, P., & Vignes-Lebbe, R. (2017). Les collections muséologiques. In M. Bouzeghoub & R. Mosseri (Eds.), Les Big Data à découvert (pp. 50-51). Paris: CNRS.

  • Vignes-Lebbe, R. (2017). Langage naturel, langage formel et description du vivant. In T. Gaudin, D. Lacroix, M.-C. Maurel & J. C. Pomerol (Eds.), Sciences de la Vie et Sciences de l'Information . London: ISTE Editions.

  • Diep Thi M-H., Gurgand J., Vignes Lebbe R., Nguyen H-P., Nguyen B-L., Haevermans T. (2016). Bambous d'Indochine: descripteurs morphologiques pour l’identification. Science and Technology Commitee. Viet nam National University of Ho Chi Minh city. 269 p. ISBN 978-604-73-4238-9

  • Vignes Lebbe R., Chesselet P., Diep Thi M-H. (2016). Xper3: new tools for collaborating, training and transmitting knowledge on botanical phenotypes. In "Botanists of the twenty-first century: roles, challenges and opportunities", Noëline R. Rakotoarisoa, Stephen Blackmore and Bernard Riera editors, UNESCO, Paris ISBN 978-92-3-100120-8. 228-239

  • Cavoto, P., Cardoso, V., Lebbe, R., and Santanche, A. (2015). Fishgraph: A network-driven data analysis (submitted)

  • Grand, A.; Lebbe, R.V.; Santanche, A., "From Phenotypes to Trees of Life: A Metamodel-Driven Approach for the Integration of Taxonomy Models," in e-Science (e-Science), 2014 IEEE 10th International Conference on , vol.1, no., pp.65-72, 20-24 Oct. 2014 doi: 10.1109/eScience.2014.48

  • Thacker RW, Díaz MC, Kerner A, Vignes-Lebbe R, Segerdell E, Haendel MA, Mungall CJ. 2014. The Porifera Ontology (PORO): enhancing sponge systematics with an anatomy ontology. Journal of Biomedical Semantics 5:39. doi: 10.1186/2041-1480-5-39.

  • Chrétiennot-Dinet M-J, Desreumaux N, Vignes-Lebbe R. An interactive key to the Chrysochromulina species (Haptophyta) described in the literature. PhytoKeys 2014;(34):47-60. doi:10.3897/phytokeys.34.6242.

  • Hardisty A., Roberts D. and The Biodiversity Informatics Community 2013. A decadal view of biodiversity informatics: challenges and priorities. BMC Ecology, 13:16.

  • Thomas Burguiere, Florian Causse, Visotheary Ung, and Régine Vignes-Lebbe, 2013: IKey+: A New Single-Access Key Generation Web Service Syst Biol (2013) 62(1): 157-161.

  • Zaragüeta-Bagils R., Ung V., Grand A., Vignes-Lebbe R., Cao N., Ducasse J, 2012 : LisBeth : New cladistics for phylogenetics and biogeography. C.R Palevol 11(8):563-566.

  • Noël Conruyt, David Grosser, Régine Vignes-Lebbe. Knowledge Discovery for Biodiversity: from Data Mining to Sign Management. iEMSs Sixth Biennial Meeting: International Congress on Environmental Modelling and Software, Jul 2012, Leipzig, Germany. pp.en ligne. ⟨hal-01188009⟩

  • Mathieu Bruno, Cêtre-Sossah Catherine, Garros Claire, Chavernac David, Balenghien Thomas, Carpenter Simon, Setier-Rio Marie-Laure, Vignes-Lebbe Régine, Ung Visotheary, Candolfi Ermanno and Delécolle Jean-Claude, 2012. Development and validation of IIKC: an interactive identification key for Culicoides (Diptera: Ceratopogonidae) females from the Western Palaearctic region. Parasites & Vectors 2012, 5:137 doi:10.1186/1756-3305-5-137

  • Kerner A., Vignes Lebbe R. & Debrenne F. (2011).- Computer-aided identification of the Archaeocyatha genera now available online.- Carnets de Géologie - Notebooks on Geology, Brest, Letter 2011/02 (CG2011_L02), p. 99-102, 2 figs. voir...
  • Nimis P.L., Vignes Lebbe R. (eds.), 2010 : Tools for Identifying Biodiversity: Progress and Problems. ISBN 978-88-8303-295-0, EUT, 455 pp. voir...
  • Noël Conruyt, Didier Sébastien, Régine Vignes-Lebbe, Salima Cosadia, . Moving from Biodiversity Information Systems to Biodiversity Information Services. Information and Communication Technologies for Biodiversity Conservation and Agriculture, Maurer, Lisa and Tochtermann, Klaus, pp.107-128, 2010, 978-3-8322-8459-6. ⟨hal-01186489⟩

  • Ung V., Dubus G., Zaragüeta-Bagils R. & Vignes-Lebbe R., 2010 : Xper²: introducing e-Taxonomy. Bioinformatics, Vol. 26, Num.5: 703-704.
  • Zaragüeta-Bagils R., Bourdon E., Ung V., Vignes-Lebbe R. et Malécot V., 2009 : Comments on the International Code of Area Nomenclature. Journal of Biogeography, 38 : 1617-1619.
  • Messiaen S., Vignes-Lebbe R., Aragon S., 2008. La reflexion semantica: primera etapa en el proceso de informatizacion de una coleccion universitaria de ciencias naturals con vocacion pedagogica. Revista de Museologia #43: 56-65.
  • Cao, N., Zaragüeta-Bagils, R. & Vignes-Lebbe, R. , 2007. A hierarchical representation of the hypothesis of homology. Geodiversitas 29:5-15.
  • Jacques, F. Gallut, C. Vignes-Lebbe, R. & Zaragüeta Bagils, R., 2007. Resolving phylogenetic reconstruction in Menispermaceae (Ranunculales) using fossils and a novel statistical test. Taxon 56 (2) : 379-392